一、做好孵前的清洗消毒工作。
剛產出的鴨蛋外殼上有100-300個細菌，1小時后達到5000-6000個，尤其在高溫季節細菌繁殖快，容易經蛋殼上的氣孔進入蛋內，造成污染，如不消毒勢必影響孵化。消毒方法可選用0.02%高錳酸鉀或5%新潔爾滅溶液，用40攝氏度左右的溫水配置洗滌種蛋，晾后入孵，消毒液要經常更換，現配現用，也可選用福爾馬林熏蒸消毒，每立方米用福爾馬林28毫升，高錳酸鉀14克，熏蒸20分鐘，然后打開門窗，盡快將氣體排除。
二、及時入孵或合理保存種蛋。
南方地區6-9月份平均氣溫在27攝氏度以上，當溫度高于23.9攝氏度時種蛋胚胎就會發育緩慢，甚至衰老死亡。不能及時入孵的種蛋應存放在種蛋貯藏室，有自動控制溫度、濕度與通風的設備，以及有翻蛋裝置。貯藏溫度在10-15攝氏度。
三、適當調低機內溫度。
一般0-3天胚齡37.8攝氏度，，4-7天胚齡37.5攝氏度，8-14天胚齡37.5攝氏度，21-25天胚齡37.2攝氏度。26天胚齡上攤床。
四、適當增加涼蛋和噴水的次數和時間。
從第8天胚齡起每天噴水一次，12天胚齡起每天噴水二次，從第16天胚齡起每天噴水三次，直到上攤孵化。5天胚齡以后每天早、晚各涼蛋一次，每次約20-25分鐘，使蛋殼溫度下降到32攝氏度左右，然后開機孵化。
五、嚴防超溫孵化
由于目前大多數孵化場并未安裝空調，高溫季節室溫常達30攝氏度以上，所以種蛋胚胎發育到16-17天胚齡后，由于胚胎自身產生熱量，容易超溫，即使孵化機內發熱裝置長期處于斷熱及通風孔全部打開，仍無法把胚胎發育的代謝熱全部排出，這種情況下就應把前后機門打開一條約幾厘米的縫隙，以加速排熱，這樣可以防止超溫?！?
